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全基因組測序:罕見病診斷的未來?

發(fā)布時間:2017-11-01 10:41:01瀏覽次數(shù):3112

 

2年前,比里(Beery)家的女兒阿麗克西斯得了很嚴(yán)重的咳嗽癥。她總是日夜咳個不停,所以家人特別雇了一個人在她睡覺的時候看著她,防止出現(xiàn)意外。有的時候,阿麗克西斯甚至?xí)鹊脟I吐。對這種情況,醫(yī)生們完全沒有頭緒,只能給她注射腎上腺素類的藥物,讓她可以呼吸。(題圖為阿麗克西斯一家)

阿麗克西斯和她的雙胞胎弟弟諾亞(Noah)患有一種罕見的遺傳?。憾喟头磻?yīng)性肌張力失常(Dopa-responsive dystonia)。不過長期以來,他們身上的疾病都被很好的控制著。所以當(dāng)阿麗克西斯突然出現(xiàn)咳嗽和呼吸困難的癥狀的時候,醫(yī)生不認(rèn)為這是由多巴反應(yīng)性肌張力失常癥引起的。

這對雙胞胎的父親喬(Joe)在加州的一家生物技術(shù)公司工作。在他的努力下,這家生物公司同意提供資金對阿麗克西斯和她的雙胞胎弟弟進(jìn)行基因測序。研究表明,他們的體內(nèi)的一個叫SPR的基因出現(xiàn)了突變。SPR基因編碼了一種酶,而這種酶被認(rèn)為和多巴反應(yīng)性肌張力失常有關(guān)。

知道了病因就好辦多了。SPR編碼的酶可以促進(jìn)兩種神經(jīng)遞質(zhì)的合成。其中一種已經(jīng)是姐弟倆的藥物了。所以醫(yī)生把另一種藥物也開給了他們?,F(xiàn)在,阿麗克西斯的咳嗽和呼吸癥狀已經(jīng)消失了,可以在操場上跑步踢球。

整個研究是由美國德州休斯頓市的貝勒醫(yī)學(xué)院 人類基因測序中心(Baylor College of Medicine Human Genome Sequencing Center)的科學(xué)家完成的。研究結(jié)果發(fā)表在6月15日的《科學(xué)•轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》 (Science Translational Medic ine)上。

這篇文章意義重要,因為這是基因測序技術(shù)在罕見病治療上的一次成功應(yīng)用。罕見病往往是遺傳疾病,病人的某些或某個基因出現(xiàn)了少見的突變。顧名思義,罕見病患者人數(shù)不多,所以不容易引起社會的關(guān)注,研究經(jīng)費的來源也少些。而且,因為罕見病的病例稀少,所以也很難組織大規(guī)模的醫(yī)學(xué)實驗。更糟糕的是,因為對罕見病了解甚深的專家數(shù)量也很少,所以經(jīng)常出現(xiàn)誤診的情況。

不過,《科學(xué)•轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》上的這篇論文說明基因測序可以成為一種有希望的診斷方法。一次基因測序就可以發(fā)現(xiàn)所有可能出現(xiàn)的基因突變。論文的作者之一理查德.吉布斯(Richard Gibbs)認(rèn)為,在未來的3到4年內(nèi),90%的單基因突變引起的疾病會得到解決。

現(xiàn)在的問題是,全基因組測序的成本仍然太高了。以這項研究為例,給這對雙胞胎測序的價格大約是6萬美元,而整個過程的費用大約是10萬美元,還花了兩個月的時間。其它的一些公司的測序費用便宜一些,價格能抵到5000美元至7500美元。研究人員估計,當(dāng)對單個病人的測序費用降至1000美元的時候,測序技術(shù)就能在臨床上得到廣泛應(yīng)用了。

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